「Amazonネットスーパー」は、生鮮食品から飲料、日用品までを、注文から最短2時間で届けるサービス。同サービスのうち、「Amazonフレッシュ」は、東京・神奈川・千葉・埼玉で展開している。ライフネットスーパーや成城石井ネットスーパーなど、提携する複数のネットスーパーも、サービス提供を行っている。
現在は主に、関東圏と関西圏、愛知、北海道の対象エリアでネットスーパーサービスを展開している。2024年中には新たに、リテールパートナーズとの協業開始も予定している。福岡市と一部周辺エリアで、ネットスーパーサービスの提供を開始する予定だという。
プライム会員は特典として、1回あたりの通常配送料が200円安くなる。各ネットスーパーで一定金額以上注文すると、配送料が無料になる特典もあるという。